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量子計(jì)算助力創(chuàng)新藥物研發(fā),技術(shù)升級(jí)引領(lǐng)制藥業(yè)革命

  制藥業(yè)是一個(gè)與人類健康和生命息息相關(guān)的行業(yè),它也是一個(gè)不斷創(chuàng)新和進(jìn)步的行業(yè)。在過(guò)去的幾十年里,制藥業(yè)經(jīng)歷了從化學(xué)合成藥、生物制品藥、基因工程藥、納米藥物等不同階段的發(fā)展,涌現(xiàn)了許多具有重大意義和影響的新型藥物,為治療各種疾病和改善人類福祉做出了巨大貢獻(xiàn)。同時(shí),制藥業(yè)也面臨著從市場(chǎng)競(jìng)爭(zhēng)、法規(guī)政策、社會(huì)需求等多方面的挑戰(zhàn)和壓力,需要不斷適應(yīng)變化和尋求突破。其中,藥物研發(fā)是一個(gè)復(fù)雜而漫長(zhǎng)的過(guò)程,它涉及到對(duì)分子結(jié)構(gòu)、化學(xué)反應(yīng)、生物活性等多方面的模擬和優(yōu)化。傳統(tǒng)的計(jì)算機(jī)在處理這些問(wèn)題時(shí),往往受到計(jì)算能力、時(shí)間和成本的限制,難以達(dá)到理想的效果。而量子計(jì)算機(jī)則可以利用其強(qiáng)大的并行性和精確性,對(duì)分子系統(tǒng)進(jìn)行高效的模擬和搜索,從而加速藥物設(shè)計(jì)的進(jìn)程,降低藥物開(kāi)發(fā)的風(fēng)險(xiǎn),提高藥物質(zhì)量和安全性。

  量子計(jì)算作為一種新興的技術(shù)領(lǐng)域,為制藥業(yè)帶來(lái)了新的機(jī)遇和希望,也提出了新的要求和問(wèn)題。量子計(jì)算可以為制藥業(yè)提供新的思路和方法,幫助制藥企業(yè)提升研發(fā)能力,加速創(chuàng)新速度,降低開(kāi)發(fā)成本,提高產(chǎn)品質(zhì)量,拓展市場(chǎng)空間。但是,量子計(jì)算也需要制藥企業(yè)投入更多的資源和精力,掌握更多的知識(shí)和技能,建立更好的合作和溝通,解決更多的難題和風(fēng)險(xiǎn)。

  本期二十五周年專欄中,我們關(guān)注量子計(jì)算在藥物研發(fā)中的原理、應(yīng)用和前沿進(jìn)展的認(rèn)識(shí)和看法,以及對(duì)量子計(jì)算對(duì)制藥業(yè)未來(lái)發(fā)展的影響和啟示的思考和建議,希望提供一個(gè)全面而深入的視角,更好地了解量子計(jì)算這一革命性的新技術(shù)在藥物研發(fā)領(lǐng)域中的作用和價(jià)值,以及它對(duì)制藥業(yè)未來(lái)發(fā)展的挑戰(zhàn)和機(jī)遇。

  量子計(jì)算在藥物研發(fā)中的原理

  藥物研發(fā)是一個(gè)涉及到多學(xué)科交叉的領(lǐng)域,它需要對(duì)分子結(jié)構(gòu)、化學(xué)反應(yīng)、生物活性等多方面進(jìn)行深入的研究和分析。其中,一個(gè)關(guān)鍵的步驟就是藥物設(shè)計(jì),即根據(jù)目標(biāo)受體或酶的結(jié)構(gòu)和功能,設(shè)計(jì)出能夠與之結(jié)合并產(chǎn)生預(yù)期效果的候選藥物分子。這個(gè)過(guò)程通常包括幾個(gè)階段。

  首先是分子對(duì)接,通過(guò)計(jì)算機(jī)模擬分析候選藥物分子與目標(biāo)受體或酶之間的空間構(gòu)型、相互作用能量、結(jié)合模式等參數(shù),篩選出最優(yōu)化的配體。然后是分子動(dòng)力學(xué),通過(guò)計(jì)算機(jī)模擬分析候選藥物分子與目標(biāo)受體或酶在不同溫度、壓力、溶劑等條件下的運(yùn)動(dòng)軌跡、穩(wěn)定性、可行性等參數(shù),評(píng)估其動(dòng)態(tài)行為。接下來(lái)則是藥效預(yù)測(cè),通過(guò)計(jì)算機(jī)模擬分析候選藥物分子在體內(nèi)外環(huán)境中的代謝途徑、生物利用度、毒性副作用等參數(shù),預(yù)測(cè)其藥理活性。

  每個(gè)階段都需要對(duì)大量復(fù)雜的分子系統(tǒng)進(jìn)行精確而高效的模擬和搜索,這對(duì)傳統(tǒng)的計(jì)算機(jī)來(lái)說(shuō)是一個(gè)巨大的挑戰(zhàn)。傳統(tǒng)的計(jì)算機(jī)使用二進(jìn)制比特作為信息單元,每個(gè)比特只能表示0 或1 兩種狀態(tài)。因此,要表示一個(gè)n 位長(zhǎng)的分子結(jié)構(gòu),就需要n 個(gè)比特。而要表示一個(gè)含有n 個(gè)原子的分子系統(tǒng),則需要2n 個(gè)比特。這意味著隨著分子系統(tǒng)規(guī)模的增加,所需的比特?cái)?shù)將呈指數(shù)級(jí)增長(zhǎng),超出了傳統(tǒng)計(jì)算機(jī)的存儲(chǔ)和處理能力。

  而量子計(jì)算機(jī)則使用量子比特作為信息單元,每個(gè)量子比特可以同時(shí)表示0 和1 兩種狀態(tài),這就是量子疊加的特性。因此,一個(gè)量子比特可以表示兩個(gè)分子結(jié)構(gòu),n 個(gè)量子比特可以表示2n 個(gè)分子結(jié)構(gòu)。這意味著量子計(jì)算機(jī)可以利用其并行性,同時(shí)處理多個(gè)分子系統(tǒng),大大提高了計(jì)算效率。此外,量子計(jì)算機(jī)還可以利用量子糾纏的特性,實(shí)現(xiàn)對(duì)分子系統(tǒng)的精確控制和測(cè)量,從而提高了計(jì)算精度。

  量子計(jì)算在藥物設(shè)計(jì)中,可以利用量子搜索算法(如Grover 算法),在指數(shù)級(jí)的候選藥物分子中快速找出最優(yōu)化的配體;也可以利用量子模擬算法(如變分量子本征求解器VQE),在多項(xiàng)式級(jí)的時(shí)間內(nèi)模擬分子系統(tǒng)的本征態(tài)和本征能。此外在藥效預(yù)測(cè)方面,利用量子機(jī)器學(xué)習(xí)算法(如量子神經(jīng)網(wǎng)絡(luò)QNN),可以在多項(xiàng)式級(jí)的時(shí)間內(nèi)學(xué)習(xí)和預(yù)測(cè)分子系統(tǒng)的藥理活性。

  在藥物研發(fā)中的應(yīng)用

  量子計(jì)算在藥物研發(fā)中的應(yīng)用已經(jīng)引起了全球各大制藥公司、科研機(jī)構(gòu)和技術(shù)企業(yè)的廣泛關(guān)注和投入。例如,2021 年,谷歌(Google)與全球領(lǐng)先的研發(fā)驅(qū)動(dòng)制藥公司勃林格殷格翰(Boehringer Ingelheim)達(dá)成合作協(xié)議,專注于研究和實(shí)施量子計(jì)算在藥物研發(fā)領(lǐng)域中的前沿用例,其中包括分子動(dòng)力學(xué)模擬。新的合作關(guān)系將其在計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)、計(jì)算機(jī)建模領(lǐng)域的專業(yè)知識(shí),與作為量子計(jì)算機(jī)和算法的領(lǐng)先開(kāi)發(fā)商之一的谷歌所擁有的優(yōu)質(zhì)資源結(jié)合在了一起。

  而此前,2018 年,微軟(Microsoft)與凱斯西儲(chǔ)大學(xué)(Case Western Reserve University)合作,為了改善病人的護(hù)理,凱斯西儲(chǔ)使用微軟的量子啟發(fā)的算法,以加強(qiáng)其檢測(cè)癌癥腫瘤的方法。

  埃森哲(Accenture)和默克(Merck)在2018 年與亞馬遜網(wǎng)絡(luò)服務(wù)(AWS)合作,推出了一個(gè)基于云的信息學(xué)研究平臺(tái),幫助生命科學(xué)行業(yè)的組織在藥物開(kāi)發(fā)的早期階段提高生產(chǎn)力、效率和創(chuàng)新。通過(guò)為核心研究功能創(chuàng)建開(kāi)放的、行業(yè)標(biāo)準(zhǔn)的應(yīng)用程序編程界面,使研究人員能夠迅速采用新的功能,從而建立一個(gè)加速創(chuàng)新的生態(tài)系統(tǒng)。科學(xué)應(yīng)用提供商、內(nèi)容提供商和技術(shù)創(chuàng)新者將受益于較低的進(jìn)入壁壘,新的能力更容易進(jìn)入市場(chǎng),幫助生命科學(xué)公司重新設(shè)想過(guò)程、用戶體驗(yàn)和數(shù)據(jù)密集型研究方法。

  前沿突破

  今年初,谷歌宣布,在糾正當(dāng)今量子計(jì)算機(jī)固有的錯(cuò)誤方面取得了突破,其的研究結(jié)果已發(fā)表在《自然》(Nature)期刊上。研究人員表示,他們已經(jīng)找到了一種方法,可以將量子計(jì)算機(jī)處理的信息通過(guò)多個(gè)量子比特傳播,這意味著整個(gè)系統(tǒng)可以保留足夠的信息來(lái)完成計(jì)算,即使單個(gè)量子比特脫離了它們的量子態(tài)。這是一個(gè)重要的里程碑,為實(shí)現(xiàn)大規(guī)模和高質(zhì)量的量子計(jì)算奠定了基礎(chǔ)。

  另一方面,通過(guò)互聯(lián)網(wǎng)提供遠(yuǎn)程訪問(wèn)和使用量子計(jì)算機(jī)資源的服務(wù),可以讓更多的用戶和開(kāi)發(fā)者享受到量子計(jì)算的便利和優(yōu)勢(shì)。目前,谷歌、微軟、IBM、亞馬遜等技術(shù)巨頭都已經(jīng)推出了自己的量子云服務(wù)平臺(tái),并與各大制藥公司、科研機(jī)構(gòu)和技術(shù)企業(yè)建立了合作關(guān)系,共同探索量子計(jì)算在藥物研發(fā)領(lǐng)域中的應(yīng)用場(chǎng)景和解決方案。

  量子計(jì)算對(duì)制藥業(yè)未來(lái)發(fā)展的影響和啟示

  量子計(jì)算作為一種革命性的新型計(jì)算模式,對(duì)制藥業(yè)未來(lái)發(fā)展將產(chǎn)生深遠(yuǎn)而廣泛的影響和啟示。在創(chuàng)新藥物研發(fā)方面,量子計(jì)算可以大大提高藥物設(shè)計(jì)的效率和精度,從而加速創(chuàng)新藥物研發(fā)的進(jìn)程,降低藥物開(kāi)發(fā)的風(fēng)險(xiǎn)和成本,提高藥物質(zhì)量和安全性。這將為人類健康帶來(lái)新的希望和福祉,尤其是對(duì)于一些難治性疾病、罕見(jiàn)病、新型病毒等領(lǐng)域。

  而對(duì)于制藥業(yè)轉(zhuǎn)型升級(jí)來(lái)說(shuō),量子計(jì)算可以為制藥業(yè)提供新的技術(shù)驅(qū)動(dòng)力和競(jìng)爭(zhēng)優(yōu)勢(shì),促進(jìn)制藥業(yè)轉(zhuǎn)型升級(jí),實(shí)現(xiàn)從傳統(tǒng)制造型向智能創(chuàng)新型的跨越。這將要求制藥企業(yè)加強(qiáng)對(duì)量子計(jì)算技術(shù)的關(guān)注和投入,培養(yǎng)和引進(jìn)量子計(jì)算人才,建立和完善量子計(jì)算基礎(chǔ)設(shè)施和生態(tài)系統(tǒng),與量子計(jì)算技術(shù)提供商建立緊密的合作關(guān)系。

  此外,對(duì)于無(wú)法忽視的制藥業(yè)監(jiān)管和倫理,量子計(jì)算也會(huì)給制藥業(yè)帶來(lái)新的挑戰(zhàn)和風(fēng)險(xiǎn),例如數(shù)據(jù)安全、知識(shí)產(chǎn)權(quán)、社會(huì)責(zé)任等方面。這將要求制藥業(yè)加強(qiáng)對(duì)量子計(jì)算的監(jiān)管和倫理,制定和遵守相關(guān)的法律法規(guī)、標(biāo)準(zhǔn)規(guī)范、道德準(zhǔn)則等,保護(hù)和尊重個(gè)人隱私、公共利益、人類尊嚴(yán)等。

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